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中央政府
中书省
主条目：中书省(明朝)和胡惟庸案
明朝中书省，为明朝初期至洪武十三年（1380年）期间的行政中枢。其中丞相为明朝中书省的最高级长官，负责统领六部。明初沿袭元朝制度，设立中书省，置左、右丞相。甲辰正月，初置左、右相国，其中李善长为右相国，徐达为左相国。吴元年，改右相国为左相国，左相国为右相国。洪武元年，改为左、右丞相。由中书省统六部，但不设置中书令。洪武十三年（1380年），胡惟庸案之后，明太祖朱元璋罢中书省，分中书省之权归于六部。原中书省官属尽革，惟存中书舍人。
左丞相 一人 正一品 中书省 洪武十三年废
右丞相 一人 正一品 中书省 洪武十三年废
平章政事 一人 从一品 中书省 洪武九年汰
左丞 一人 正二品 中书省 洪武十三年废
右丞 一人 正二品 中书省 洪武十三年废
参知政事 一人 从二品 中书省 洪武九年汰
郎中 一人 正五品 中书省左司 洪武十三年废
郎中 一人 正五品 中书省右司 洪武十三年废
员外郎 一人 正六品 中书省 洪武十三年废
都事 一人 正七品 中书省 洪武十三年废
检校 一人 正七品 中书省 洪武二年革
照磨 一人 从七品 中书省 洪武二年革
管勾 一人 从七品 中书省 洪武十三年废
参议 一人 正三品 中书省参议府 吴元年革
参军 一人 从三品 中书省 洪武十三年废
断事官 一人 从三品 中书省 洪武二年革
断事 一人 正七品 中书省 洪武十三年废
经歷 一人 正七品 中书省 洪武十三年废
知事 一人 正八品 中书省 洪武十三年废
都镇抚 一人 正五品 中书省都镇抚司 甲辰十月以都镇抚司隶大都督府，后废
考功郎 一人 正七品 中书省考功所 洪武元年革
中书舍人 十人 从七品 中书省 旧名直省舍人
内阁
主条目：明朝内阁
参见：明朝内阁辅臣年表
明朝内阁制度，为明成祖首先确立。内阁乃建文四年（1402年）至崇禎十七年（1644年）的皇帝咨政机构，此后权力逐渐增大，后形成为明朝行政中枢。内阁辅臣的人数为一人至七人不等，辅臣奉使出外办事，多自称阁部。明太祖废除宰相。起初，内阁大学士只具有顾问身份，皇帝为最终决定的权力，而大学士很少有参决的机会。到明仁宗、明宣宗时期，大学士均因有太子经师的恩情，而得以累加至太子三孤身份，地位日益受尊崇。宣宗时期，朝廷事无大小，宣宗均悉数諮询大学士杨士奇的看法而决定。虽然吏部尚书蹇义、户部尚书夏原吉召见时得以参与各部事宜，然而其还远不如杨士奇等内阁成员得以亲自接见。自此，内阁的权力日益增大，到明世宗中叶，夏言、严嵩等人执掌内阁，地位赫然为真正的宰相，亦可压制六部[。
中极殿大学士 一人 正五品
建极殿大学士 一人 正五品
文华殿大学士 一人 正五品
武英殿大学士 一人 正五品
文渊阁大学士 一人 正五品
东阁大学士 一人 正五品
六部
参见：明朝尚书与都御史年表和南京六部
明朝中书省时期，七卿长官均为正三品。洪武十三年，朱元璋罢中书，仿《周官》六卿之制，升六部秩，各设尚书、侍郎一人。六部包括吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部，其所属最高长官为明朝吏部尚书、明朝户部尚书、明朝礼部尚书、明朝兵部尚书、明朝刑部尚书、明朝工部尚书，其常常与都察院之都御史、通政使司之通政使、大理寺之大理寺卿合称「九卿」。明朝时，重臣任择须由九卿及外省巡抚、总督公开举荐，此为廷推。各部司不能单独决定的国家大事、要事，须经九卿公决，此为廷议。而由三法司无法决定的大型狱讼，以由九卿开会定狱，此为廷鞠或园审。其与明朝内阁构成了明朝的行政权力中心与决策核心。
吏部
吏部尚书 一人 正二品 吏部
吏部左侍郎 一人 正三品 吏部
吏部右侍郎 一人 正三品 吏部
司务 二人 从九品 吏部司务厅
郎中 一人 正五品 吏部文选清吏司
郎中 一人 正五品 吏部验封清吏司
郎中 一人 正五品 吏部稽勛清吏司
郎中 一人 正五品 吏部考功清吏司
员外郎 一人 从五品 吏部
主事 一人 正六品 吏部
主事 一人 正六品 吏部文选清吏司 洪武三十一年增设
主事 一人 正六品 吏部考功清吏司 正统十一年增设
户部
名称 人数 秩品 所属 备註
户部尚书 一人 正二品 户部
户部左侍郎 一人 正三品 户部
户部右侍郎 一人 正三品 户部
司务 二人 从九品 户部司务厅
郎中 一人 正五品 户部浙江清吏司
郎中 一人 正五品 户部江西清吏司
郎中 一人 正五品 户部湖广清吏司
郎中 三人 正五品 户部陕西清吏司
郎中 一人 正五品 户部广东清吏司
郎中 二人 正五品 户部山东清吏司
郎中 一人 正五品 户部福建清吏司
郎中 一人 正五品 户部河南清吏司
郎中 四人 正五品 户部山西清吏司
郎中 一人 正五品 户部四川清吏司
郎中 一人 正五品 户部广西清吏司
郎中 三人 正五品 户部贵州清吏司
郎中 三人 正五品 户部云南清吏司
员外郎 一人 从五品 户部
员外郎 一人 从五品 户部四川清吏司 宣德七年增设，后仍革。
员外郎 一人 从五品 户部云南清吏司 宣德七年增设，后仍革。
主事 七人 正六品 户部云南清吏司
主事 二人 正六品 户部浙江清吏司
主事 二人 正六品 户部江西清吏司
主事 二人 正六品 户部湖广清吏司
主事 二人 正六品 户部陕西清吏司
主事 二人 正六品 户部福建清吏司
主事 二人 正六品 户部河南清吏司
主事 二人 正六品 户部山西清吏司
主事 一人 正六品 户部山东清吏司
主事 一人 正六品 户部四川清吏司
主事 一人 正六品 户部贵州清吏司
照磨 一人 正八品 户部照磨所
检校 一人 正九品 户部
提举 一人 正八品 户部宝钞提举司
副提举 一人 正九品 户部宝钞提举司 后革
典史 一人 未入流 户部宝钞提举司 后革
大使 一人 正九品 户部钞纸局
副使 一人 从九品 户部钞纸局 后革
大使 一人 正九品 户部印钞局 后革
副使 一人 从九品 户部印钞局 后革
大使 一人 正九品 户部宝钞广惠库
副使 二人 从九品 户部宝钞广惠库 嘉靖中革
大使 一人 正九品 户部广积库
副使 一人 从九品 户部广积库 嘉靖中革
典史 一人 未入流 户部广积库 嘉靖中革
大使 一人 正九品 户部赃罚库
副使 二人 从九品 户部赃罚库 嘉靖中革
大使 五人 正九品 户部甲字、乙字、丙字、丁字、戊字库
副使 六人 从九品 户部甲字、乙字、丙字、丁字、戊字库 丁字库二人，嘉靖中革一人，并革乙字、戊字二库副使。
大使 一人 从九品 户部广盈库
副使 二人 未入流 户部广盈库 嘉靖中革
大使 二人 正九品 户部外承运库 后革
副使 二人 从九品 户部外承运库 后革
大使 一人 正九品 户部承运库
副使 一人 从九品 户部承运库 嘉靖中革。行用库
大使 一人 未入流 户部行用库 后革
副使 一人 未入流 户部行用库 后革
大使 一人 未入流 户部太仓银库
副使 一人 未入流 户部太仓银库 嘉靖中革，御马仓
大使 一人 从九品 户部御马仓
副使 一人 未入流 户部御马仓
大使 一人 从九品 户部军储仓 后革
副使 一人 未入流 户部军储仓 后革
副使 四人 未入流 长安、东安、西安、北安门仓，各副使一人
仓旧 二人 未入流 户部东安门 万历八年革一人，张家湾盐仓检校批验所
大使 一人 未入流 张家湾盐仓检校批验所 隆庆六年革
副使 一人 未入流 张家湾盐仓检校批验所 隆庆六年革
礼部
礼部尚书 一人 正二品 礼部
礼部左侍郎 一人 正三品 礼部
礼部右侍郎 一人 正三品 礼部
司务 二人 从九品 礼部司务厅
郎中 一人 正五品 礼部仪制清吏司
郎中 一人 正五品 礼部祠祭清吏司
郎中 一人 正五品 礼部主客清吏司
郎中 一人 正五品 礼部精膳清吏司
员外郎 一人 从五品 礼部
主事 一人 正六品 礼部
主事 二人 正六品 礼部仪制清吏司
主事 一人 正六品 礼部祠祭清吏司
主事 一人 正六品 礼部主客清吏司
大使 一人 未入流 礼部铸印局
副使 二人 未入流 礼部铸印局 万历九年革一人
兵部
兵部尚书 一人 正二品 兵部
兵部左侍郎 一人 正三品 兵部
兵部右侍郎 一人 正三品 兵部
司务 二人 从九品 兵部司务厅
郎中 二人 正五品 兵部武选清吏司
郎中 二人 正五品 兵部职方清吏司
郎中 二人 正五品 兵部车驾清吏司
郎中 一人 正五品 兵部武库清吏司 万历九年并革
员外郎 一人 从五品 兵部
员外郎 一人 从五品 兵部武选清吏司 后革
员外郎 一人 从五品 兵部武库清吏司 后革
员外郎 一人 从五品 兵部职方清吏司
主事 二人 正六品 兵部
主事 三人 正六品 兵部武选清吏司
主事 四人 正六品 兵部职方清吏司
主事 二人 正六品 兵部车驾清吏司
主事 一人 正六品 兵部武库清吏司 后革
大使 一人 正九品 兵部会同馆
副使 二人 从九品 兵部会同馆
大使 一人 未入流 兵部大通关
副使 一人 未入流 兵部大通关
刑部
